Die bundesweit stark gefährdete Gelbbauchunke (Bombina variegata) kommt noch in einigen Fördergebieten vor.
Für die stark gefährdete Kreuzotter (Vipera berus) gibt es Einzelnachweise in verschiedenen Fördergebieten - ursprünglich stellten die Kreuzotter-Vorkommen auf der Baar die Verbindung zwischen den Populationen auf der Schwäbischen Alb und im Schwarzwald dar. Diese besteht heute aufgrund der Bestandsrückgänge vermutlich nicht mehr, ist aber ein weiteres Beispiel für die Bedeutung der Baar als Drehkreuz des Biotopverbundes in Baden-Württemberg.
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